脑炎的患者没有意识，首先要进行醒脑治疗，临床上常用的药物有醒脑静、复方麝香、清开灵注射液，必要时也可以口服安宫牛黄丸，也可以应用纳洛酮均具有一定的醒脑作用。
同时，要积极的治疗原发病，比如病毒性脑炎时，可以应用阿昔洛韦和更昔洛韦抗病毒治疗。细菌性脑炎可以应用头孢类抗生素抗菌治疗。真菌性脑炎可以引起氟康唑，或者是酮康唑进行抗真菌治疗。
患者如果有意识障碍，一般见于重症脑炎患者，多数有高压的表现，同时要进行降颅压治疗。