孕妇做头颅CT有风险，但是风险并不高。
虽然辐射会导致胎儿有畸形的可能，但是需要达到一个很高的辐射量，在怀孕早期至少要达到50mSV才有可能导致胎儿的畸形，而且也只是存在可能，不是一定会。而做一次头部CT的检查，所受到的辐射量约为2mSV，远远低于可能存在风险的剂量。现在的检查防护做得都是非常好，做头部CT检查会对非扫描野的位置进行遮挡。
总之孕妇应该尽量避免做CT检查，如果必须做，也没有必要因此选择终止妊娠。