肛周脓肿是会导致肛门疼痛的。肛周脓肿属于细菌感染引起的炎性疾病，其主要的临床表现是会在肛门部位形成脓包，当脓腔的压力增高时，会导致肛门疼痛剧烈，还可伴有皮肤升温、肛门灼热、发烧、寒颤等症状。
出现肛门疼痛也有可能是其他的原因引起的，如痔疮脱出肛门发生嵌顿、肛窦炎、肛裂、肛乳头瘤等这些疾病，也可导致肛门疼痛。
因此，出现肛门疼痛需要到肛肠科完善肛门指诊、肛门镜等相关检查，明确引起肛门疼痛的病因，对症治疗。如果是肛周脓肿引起的肛门疼痛，要尽快做手术切开引流，并要控制炎症，才可缓解疼痛。