医用外科口罩和一次性口罩是两种不同材质的口罩，医用外科口罩的过滤层是熔喷的过滤层，这种过滤层相对比较细密，它的材质不是纸。
而一次性口罩的过滤层是无纺布材料，另外一次性口罩的过滤层与内外层的材质是一样的都是无纺布的。一次性口罩主要用于阻挡灰尘或者颗粒物等，一般情况下，需要佩戴16层的一次性口罩才和佩戴医用外科口罩的效果差不多。
医用外科口罩卫生要求较高，比较而言，医用外科口罩还有阻隔液体喷溅的效果，可以使得医生在手术时有效的保护自身。