肝血管肉瘤的细胞来源于肝窦细胞，是由肝窦细胞异形增生形成的，发病的原因可能和患者接触聚氯乙烯有一定的关系，属于一种血管源性的恶性肿瘤。
肝癌分为原发性肝癌和继发性肝癌，肝癌起源于肝细胞，原发性肝癌的发生和很多因素有关，有些人和肝脏的病毒感染有关，有些患者和黄曲霉菌的刺激有关，有些人长期大量饮酒，有些人食物中长期进食亚硝胺类物质。
转移性肝癌是由其他的恶性肿瘤转移而来，比如淋巴瘤，肝血管肉瘤和肝癌的临床表现没有明显的特异性，二者的恶性程度都比较高。