喉咙表皮囊肿治疗选择手术切除，喉咙表皮囊肿会影响日常生活中呼吸，饮食吞咽等功能，所以要手术切除喉咙表皮囊肿。
喉咙表皮囊肿的本质是在喉咙真皮内含有角质的囊肿，外壁由表皮构成，可能与喉咙部位炎症的增殖反应，或者是喉咙部位曾经有鱼刺等刺伤激发感染所导致的其他东西植入皮下组织；也可能是先天性的，外胚层发育异常。
当出现吞咽困难，呼吸困难等情况时，应及时就医。可手术切除喉咙表皮囊肿，同时用抗生素如头孢曲松抗感染。
在日常生活中要注意定期检查，对伤口周围皮肤的保护；注意身体，喉咙之外其它部位有无表皮囊肿，及时诊治。