巧克力囊肿的病人是可以艾灸的，但是通过艾灸在临床上只是缓解症状，作为辅助治疗会达到一定的效果，并不能彻底治愈巧克力囊肿。
因为艾灸具有疏通经络、活血化瘀、温阳舒筋的功效，所以，在局部出现疼痛的时候，可以采用艾灸的方法给予缓解。对于巧克力囊肿，建议可以采用手术的方法给予治疗，因为如果不做手术治疗，巧克力囊肿会逐渐增大，当局部压力达到一定状态的情况下，有可能会导致囊肿破裂，这样会造成严重的后果。
所以，建议给予手术进行治疗，在术后也要用药预防复发的可能性，并且建议定期复查。