使用生理盐水配合洗鼻器对鼻腔进行冲洗，本身是没有任何危害的。但是在冲洗的时候，需要使用正确的方法，如果使用方法不当，会对鼻腔以及身体造成损害。
当患者使用洗鼻器对鼻腔进行冲洗时，如果用力过猛，导致水流量过大，有可能会引发鼻中隔偏曲的情况出现。另外如果不断的将鼻腔内的分泌物冲入咽鼓管，还有可能引发急性化脓性中耳炎或者是分泌性中耳炎的疾病发作。
部分患者在使用洗鼻器时，没有正常呼吸，还有可能造成鼻腔和咽喉部位呛水等异常的表现。