不同原因所引起的精子成活率低，用药也不相同。对于生殖道感染疾病所导致的精子成活率低，比如精囊炎。应根据细菌培养以及药敏试验的结果，选用敏感的抗生素进行治疗，比如阿奇霉素、头孢曲松钠等。
对于生殖激素过低所引起的精子成活率低，应当使用激素类的药物治疗，比如十一酸睾酮。能够调整内分泌紊乱，补充雄性激素，提升精子的成活率。
如果存在严重的精索静脉曲张疾病，也会导致精子成活率低，必要时应进行手术治疗。在术后恢复期间，可配合使用生精片、五子衍宗丸等药物进行调理。