对于泌尿系统结核包括肾脏结核，输尿管结核，附睾和睾丸结核以及膀胱结核等，对于泌尿系结核治疗方法主要分为药物治疗和手术治疗。
药物治疗首选异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等一线抗结核药物，必须全程足量足疗程正规用药，不可以擅自停药，以免结核复发。
对于结核播散或者造成无功能肾，甚至引起对侧肾盂积水的患者需要进行手术治疗，将结核感染的无功能肾进行切除或者造成肾脏脓肿的那么也需要进行外科手术，将脓肾切除，以免结核进一步播散。