脓肿切开引流术是否疼痛取决于麻醉方式的选择，不同部位、不同大小的脓肿，其切开引流时选择的麻醉方式也不同。
一般情况下脓肿切开引流是选择在局部麻醉的方式下进行，如皮肤表面的脓肿等，患者会有不同程度的疼痛不适。
如果是肛周等部位发生的脓肿，患者疼痛剧烈，局部麻醉下往往完成不了该手术，需要在椎管内麻醉或全身麻醉下进行脓肿切开引流，其手术过程中患者是感觉不出来疼痛，而且术后患者还可以使用镇痛泵来缓解疼痛。