偏头痛发作时，如果全身不舒服，应当及时地给予终止偏头痛发作的药物治疗，包括双氯芬酸钠、布洛芬、塞来昔布、佐米曲普坦、曲马多缓释片等。很多患者在控制偏头痛的症状后，全身不舒服的症状也能得到缓解。如果症状持续不能缓解，还需要给予一些抗焦虑、抗抑郁的药物治疗。
因为偏头痛反复发作，也会导致患者形成一定的焦虑、抑郁情绪。可给予氟哌噻吨美利曲辛、度洛西汀、阿戈美拉汀等药物进行治疗。必要时还可以给予低流量的氧气吸入，来缓解患者的紧张情绪。
此外，在偏头痛发作的时候，患者需要注意休息，保证充足的睡眠，这样也能改善全身不舒服的症状。