包皮环节术操作简单，手术比较安全，绝大多数情况下是不会发生任何的并发症，但是由于操作不当可能发生以下常见的并发症。
1、出血：主要是术中止血不彻底造成，也有继发性出血，主要是由于感染所致；
2、感染：包皮环切手术感染的发生率不足10%，多为轻度的感染，局部用药处理即可；
3、水肿：多是由于包皮环节手术以后，静脉淋巴回流不畅引发的水肿；
4、疼痛：术后多由于夜间阴茎勃起，或者是部分人可能由于伤口的炎症反应造成疼痛；
5、尿道外口狭窄：这种病发症的常见于婴幼儿，包皮环切术后发生尿道溃疡，造成尿道外口的狭窄；
6、包皮切除过多或过少：多为年轻的医生手术经验不足所致；
7、阴茎损伤：这种损伤多为阴茎头的损伤，主要是由于在术中器械不适当的牵拉阴茎头，在术中麻醉药物的应用可能造成阴茎的损伤；
8、尿道损伤：阴茎腹侧缝线过深，就可能导致尿道的损伤；
9、痛性瘢痕：
10、部分病人可能出现勃起功能障碍。