患者若伴有急性结膜炎，结膜囊内分泌物增多，此时是可以用生理盐水冲洗结膜囊，可以帮助清洁结膜囊，冲洗后结膜囊内涂抗生素眼药膏，治疗效果更佳。
另外若眼内进入异物后，眼睛出现明显异物感、疼痛、畏光、流泪、睁眼困难等症状时，也可使用生理盐水冲洗患眼，可以快速清除异物，缓解眼睛症状。
在冲洗患眼时应保持患眼在较低位置，以免冲洗液流入另一只眼睛，引起健眼感染，冲洗时翻转眼睑，若感染引起眼睑结膜伪膜形成，需刮除伪膜治疗。