长期发热是否可以自愈，要根据疾病和自身抵抗力来进行判断。
引起发热的原因有很多，一般情况下感染性疾病可以导致发烧，比如病毒、细菌、真菌的感染，会引起毒素的释放和炎症的发生，产生致热源导致机体发烧。常见的由肺炎链球菌导致的大叶性肺炎，导致机体高热，但是病程比较短，一般在一周左右会自行消散。
而结核杆菌造成的午后低热，并不会自愈，必须通过抗结核药物长期治疗来缓解，但是结核病容易复发，导致发热再次发生。而一些非感染性疾病，比如癌症，会引起机体低热，并不能自愈。