先天性耳前瘘管的治疗，主要分为药物治疗和手术治疗两种。
首先，对于日常先天性耳前瘘管部位并没有明显的感染或者临床症状的患者，并不需要对耳前瘘管进行特殊处理。但是，如果耳前瘘管部位出现了明确的细菌等炎症感染，就需要使用红霉素软膏等药物进行局部涂抹。
感染严重的还需要口服阿莫西林等抗生素药物进行消炎治疗。反复出现炎症感染的耳前瘘管，或者经常有分泌物渗出的情况，就建议对耳前瘘管进行手术的切除。耳前瘘管在手术切除后，通常上述症状都可以得到有效恢复。