做核酸检测并不痛。目前，针对新冠核酸检测可以采取以下方法采集样本，例如鼻咽拭子、咽拭子、痰液或下呼吸道分泌物。因采集标本的方法不同，被检者不适感也有不同，但多不痛苦。
例如鼻咽拭子时被检者有可能不适感会强一些，但并不会引起明显的疼痛感。常用采咽拭子的方法进行核酸检测，只要被检者配合得好，一般几秒钟就能快速地完成采集。当然，部分被检者有可能咽喉部比较敏感，出现轻度的恶心，但停止操作以后能较快地缓解。
有时还可以通过抽血查新冠核酸检测，此项操作也不痛苦。故新冠核酸检测并不会引起明显的不适感或疼痛感，并不需要引起担心和紧张。