肾盂癌发病原因有很多。
肾盂癌是一种在肾盂或是肾盏上皮组织的尿路上皮的恶性肿瘤，首先，肾盂癌的发生常与接触外界的一些致癌因素有关，对于这些外界的致癌因素，比较常见的有染料皮革和橡胶油漆等，这些工业产品中都含有能使肾盂癌发病的某种致癌物质。
再者一些氨基酸代谢紊乱，长期吸烟或者服用某些特定药物的人，肾盂癌的发病率要远高于其他人的。泌尿系长期慢性感染也是可能引发肾盂癌的，还有些囊性肾盂炎、腺性肾盂炎也是有可能发展成肾盂癌的。