输尿管结石患者小便困难，表明已经出现了尿路梗阻，应当及时地进行排石处理。
对于直径较小的结石，应当考虑进行药物排石，比如排石颗粒，并且多做跳跃运动，促进结石向下排出。如果结石仍然卡在输尿管无法移动，并且结石的直径大于0.6cm时，应当考虑进行体外冲击波碎石，将结石击碎成小块的碎石，碎石会随着尿液排出体外。
如果结石直径大于1.2cm时，应当考虑进行输尿管软镜碎石取石术。在进行手术以后，还需要在输尿管内放置输尿管支架，当结石被取出以后，小便困难的症状会随之消失。