大便变灰色首先需要排除药物因素，最常见的是含有铋剂的药物，可以使大便发灰。
消化不良也可以让大便发灰，当存在消化不良时，由于有很多食物没有完全消化，就会导致大便的颜色出现改变，可以使大便变为灰色，大便还会比较稀。在排便时还会出现轻度的腹部疼痛，在改善饮食后，通常会自行缓解。
如果存在胆道堵塞的情况，比如胆管结石或者是胆道肿瘤，有可能会导致胆汁不能够进入肠道，粪胆原形成减少，就容易使大便出现灰色，严重时会导致大便出现陶土色。需要就医进行肝功能等检查明确诊断，确诊以后进行针对性治疗，防止病变持续加重。