慢性肾衰竭晚期并发症可以累及全身各个系统，具体如下：
1.代谢性酸中毒。由于酸性代谢产物潴留而引起食欲缺乏、恶心、呕吐、呼吸深长等症状。
2.水电解质紊乱。水钠潴留导致稀释性低钠血症、高钾高镁血症、高磷血症、低钙血症。
3.营养物质代谢紊乱。最突出表现为白蛋白下降，此外还可以出现低血糖、高脂血症等。
4.心血管系统。高血压、心力衰竭常见，尿毒症性心肌病也是尿毒症晚期并发症之一。
5.呼吸系统可出现肺水肿或胸腔积液。
6.胃肠道系统主要为消化道出血。
7.血液系统主要表现为肾性贫血、出血和血栓形成倾向。
8.神经肌肉系统。尿毒症性脑病表现为反应淡漠、谵妄等，感觉神经障碍主要是由周围神经病变引起。
9.内分泌功能紊乱。促红素缺乏，继发性甲旁亢以及肾性骨营养不良，主要由钙磷代谢紊乱引起。