不动杆菌肺炎在抗生素的选择上建议选择广谱的针对性抗生素，临床上用得比较多的包括环丙沙星、氧氟沙星、头孢噻肟、头孢哌酮、阿米卡星等。
具体的抗生素选择还需要根据病原体的培养及药敏试验结果来进行选择。
在抗生素治疗的同时，也要根据病人的实际情况来选择针对性治疗。因为导致不动杆菌肺炎的患者往往存在比较多的基础疾病，在针对不动杆菌肺炎治疗的过程中，也要监测患者其他系统是否出现异常，如有异常及时给予相应治疗。