发育不良会导致癫痫，轻度皮质发育不全，磁共振不能发现，通常为轻度弥漫性，并会造成癫痫。为了查明发育不良的部位和癫痫灶的范围，需要手术切除。
Ⅱ型发育不良程度很重，磁共振可以看到，但往往有限，且该型比较容易处理。由于磁共振可以看到病灶的位置、脑电图、脑地形图等，检查可以确定癫痫灶的范围。因此，服用药物控制这种皮质发育不良的可能性很小，病灶只能通过手术切除。
如果病变不是很重要，手术切除可以治愈。如果病变处于非常重要的位置，如语言区或运动区，也可以通过迷走神经刺激，甚至神经调节来解决。