头孢类药物的不良反应在临床上较常见为过敏反应，比如部分患者用药后可出现荨麻疹、皮疹、血清样反应、哮喘、药物热、血管神经性的水肿等，严重时也可导致过敏性的休克。
头孢用药的另一些常见副反应为胃肠道的不良反应，如患者出现食欲不振、消化不良，有时可伴随恶心、呕吐等这类症状。
因此，头孢类药物作为处方药，一定要遵医嘱使用，患者不要超量服用，也不要长期使用。还需注意用药前一定进行皮试，患者切记不要自行用药，也不要随意更改用药剂量和疗程。