绝大多数的甲状腺肿瘤是需要进行手术的治疗的。
对于甲状腺的良性肿瘤，在临床上比较常见的是甲状腺腺瘤。而对于甲状腺腺瘤的病人，应该早期进行包括腺瘤的患侧甲状腺大部分切除。切除的标本应该立即地进行冰冻切片的检查，从而判断有没有恶变的发生。而大多数甲状腺癌的病人主要的治疗方式也是手术的治疗，必要的时候还需要进行患侧淋巴结的清扫手术。
在术后一部分甲状腺癌的病人可以进行碘-131的放射治疗。而对于未分化型甲状腺癌的病人，由于癌症的恶性程度比较高，发展也比较迅速，通常在发病2~3个月后会出现压迫症状或者远处转移，所以一般不进行手术治疗。通常是采用外放射治疗的手段。