首先前列腺炎，前列腺液培养发现致病病原体，是选择抗菌药物治疗的依据。非细菌性前列腺炎患者，若有细菌感染征象，经一般治疗无效亦可采用抗菌药物治疗。抗菌药物选择需要注意前列腺腺泡与微循环间存在由类脂膜构成的前列腺血屏障，从屏障障碍水溶性抗生素通过，大大降低治疗效果。
当有前列腺结石存在时，结石可成为细菌的庇护体，消炎止痛流体类抗炎药可改善症状。
一般使用消炎痛内服或者使用栓剂，中药使用消炎、清热、解毒亦可以达到一定的效果。理论上作为自由基清除剂，还可清除活性氧成分减轻炎症缓解疼痛。