茎突本身的生长畸形和茎突周围组织生长异常都是引起茎突综合征的原因。
前者指的是茎突的长度、形状或者方向与正常有所差别，更容易刺激和影响周围的神经和血管发生不适反应。后者则是茎突周围的组织，例如扁桃体切除术后留下的疤痕组织，压迫或者牵拉附近的血管和神经，导致该神经和血管更有可能被刺激。
因此，不适反应往往会出现在患者转头或者咀嚼等茎突周围组织发生活动的时候，其中最常见的症状是咽痛。一般来说，本病无症状患者不用治疗，如果症状较严重则应手术。