牙髓坏死根管治疗是否疼痛，与具体情况有关。如果牙髓坏死时间较短，磨开髓腔后发现牙髓形态完整，可应用拔髓针彻底摘除牙髓，配合应用药物能够控制管腔内的感染时，一般不会出现明显疼痛。
如果牙髓坏死时间较长，牙体颜色变黑，开髓后即出现黑褐色的液体溢出，伴有恶臭时，可能已经形成大量厌氧菌的感染。
在摘除坏死牙髓、进行根管预备的过程中，有可能激惹细菌的频繁活动，甚至造成部分细菌穿出根尖孔，扩散到根尖周组织，引起根尖周炎的急性发作，造成剧烈疼痛。