矮小症治疗所需要做的检查有很多，取决于引起矮小症的病因。
假如是垂体肿瘤导致矮小症时，除了需要做血常规、尿常规以及肝肾功能的检查以外，还需要做垂体功能的检查，同时需要做脑部核磁共振的检查，明确肿瘤的大小、肿瘤的部位，并且是否对周围脑组织有压迫，这是为手术治疗做好充分的准备工作。
如果是生长激素缺乏，需要做生长激素的检查以及骨龄的测定，必要的时候还可能需要做内分泌功能的检查，排除内分泌疾病导致的矮小症。