胎儿先天畸形或者是胚胎停止发育也是可以检查染色体。
如果胎儿的染色体是正常的，畸形的问题可能是受到其它妊娠后的不良因素的影响。如果染色体发现问题，也是来对比母体的染色体是否也会存在问题，是否是遗传了父母的染色体的问题。还是因为染色体突变，而发生了畸形方面的问题，也是可以帮助做一定的推断的。
然后也可以检查病毒感染的项目或者是血糖因素或者是甲状腺功能或者免疫功能方面的情况以及男方精子质量问题，来尽量的帮助寻找原因。