肛窦炎又称为肛隐窝炎，主要是指发生于肛窦、肛门瓣的急、慢性炎症性疾病。是以渗出、肛门坠胀为主的局灶性炎症。因为该疾病症状较轻，容易被患者及医生所忽视，但它是一种重要的潜在感染病灶，约有85%的肛门直肠病变与其感染相关。因此需要积极处理肛窦感染性疾病，对于预防肛门直肠疾病有着重要的意义。
本病的发生常常认为与肛窦的解剖特点相关，解剖上肛窦底部向下、开口朝上、呈袋状，引流差，且容易受损伤。长期便秘、干硬的粪块，容易擦伤或者撕裂肛窦。或者由于肠炎、痢疾、腹泻等，稀便进入到肛窦频繁刺激肛窦及肛瓣，那么会引起引流不畅，从而引起肛窦发生炎症。