胰腺粘液性囊腺癌晚期如何治疗，主要还是在于患者的实际病情及症状决定的。晚期可以说明患者已经存在转移的情况，是可以出现腹部疼痛、黄疸、腹胀及腹腔积液的情况。
对于出现黄疸的症状，主要还是需要考虑为胰头肿瘤导致的梗阻性的黄疸，同时也是可以出现十二指肠梗阻的情况。因此对于患者，可以采取胆肠内引流及胃空肠吻合治疗的，既可以改善患者黄疸也可以改善患者进食的情况，对于疼痛需要长时间口服止痛的药物缓解的。
黄疸及梗阻改善后，可以针对胰腺囊腺癌采取化疗及靶向药物治疗。