引起肛门湿疹，最直接的原因就是肛门部位的皮肤潮湿，从而导致局部皮肤的抵抗力降低，出现湿疹样的表现。
而男性出现肛周湿疹，最常见的原因就是肛肠疾病，比如痔疮或者是肛门息肉，导致局部的直肠液漏入到肛门等部位，使肛门处于潮湿的环境。
女性出现肛门湿疹的原因，除了和男性一样以外，也与妇科炎症之间存在一定关系。当女性患者的白带分泌量过多，也能够使整个会阴处于潮湿的状态，造成阴部湿疹，能够从大、小阴唇部位蔓延到肛门周围，从而形成肛门湿疹。