起床后脑勺疼痛的原因并不复杂，具体可能包括以下几个方面：
1.最为常见原因称为落枕，通常是指颈肩局部急性筋膜炎症所引起的后枕部的疼痛、头颈部活动受限，需要给予非甾体类的消炎止痛药物应用，往往恢复较快。
2.后脑勺痛可能为枕神经的疼痛或者是后脑勺部位的带状疱疹，需要给予止痛、营养神经药物，并给予抗病毒药物等进行相关的治疗。
3.当起床感到后脑勺疼痛，如果同时伴有面部或者是肢体的麻木乏力，甚至伴有偏瘫、失语等情况时，需要引起足够的重视，可能发生脑梗或者是脑出血。需要立即送医院进行头颅CT或者是磁共振的检查，并根据检查的结果，给予相关的治疗。