较小的鼻窦囊肿，一般并无明显的临床症状，其一般危害性较小，大多是在查体时会被偶然发现。
而对于较大的鼻窦囊肿，尤其发生于筛窦和蝶窦部位容易引起感染，从而有损伤颅底硬脑膜，造成脑脊液鼻漏的危害性；并且还可因此引起眼间综合症，其症状表现为患者眼眶感觉障碍、上睑下垂、视力下降、眼球固定，甚至于会有失明的可能性，所以这种危害相对较大。
因此，若发现眼眶周围有隆起性的包块，就有可能是此类囊肿的原因。所以，及时去医院检查治疗很重要。