分泌性中耳炎很少发生并发症，分泌性中耳炎是以中耳积液，包括浆液、黏液、浆-黏液及听力下降为主要特征的中耳非化脓性炎性疾病。一般通过清除中耳积液，改善咽鼓管通气引流功能，以及病因治疗等综合治疗可以治愈。由于本病有自愈倾向，只有少数患者可出现并发症。
咽鼓管功能不良或者上鼓室长期处于负压状态，可逐渐出现鼓膜松弛部内陷袋，进而发生胆脂瘤。病程较长者伴有患者机体免疫力低下，由于持续积液刺激可造成鼓膜穿孔，黏稠的分泌物易发生机化，形成听骨链粘连，造成听力下降。
发生于小儿患者，有可能影响言语发育、学习及与他人的交流能力。