急性附睾炎大多数是由细菌感染引起的，比如尿道或膀胱感染，多由于不注意个人卫生引起，其中最常见的细菌是大肠埃希菌，金黄色葡萄球菌也可引起。近期接受过机械侵入性检查或留置导尿管的患者，及泌尿系统解剖异常的患者也容易产生附睾炎。
对于青年男性，不洁的性生活也可产生急性附睾炎，如淋球菌和沙眼衣原体等可导致性传播疾病的病原体，是引起急性附睾炎的重要原因。
除此之外，病毒也可通过血液、淋巴管或直接侵入附睾，引起附睾炎，引起局部的疼痛感等不舒服的情况。