上消化道出血的鉴别。对于上消化道出血首先需要排除消化道以外的出血因素如呼吸道的出血。口、鼻、咽喉部、肺部的出血咽入胃内后，可以出现咖啡色样胃内容物。一般都有呼吸道的症状，仔细询问病史和检查。一般可以鉴别，还需要排除一些食物或药物引起的黑便。如进食动物血、碳粉、使用铁剂和铋剂等药物可以出现黑便。根据进食的药物和食物可以鉴别。
需要和下消化道出血鉴别。如果上消化道出血短时间内大量出血也可表现为暗红色甚至鲜红色血便。如果高位小肠或右半结肠出血，血液在肠腔停留时间久的也可以出现黑便。可以通过胃镜检查进行鉴别。
另外就是上消化道出血病因的鉴别。食管胃底静脉曲张破裂出血多有高门脉高压的症状。胃镜可见食管胃底静脉曲张。腹部彩超可发现门静脉高压的征像。
消化性溃疡出血多有慢性腹痛的病史。食管贲门黏膜撕裂综合征有剧烈呕吐的病史。胃癌引起的消化道出血有长期剧烈腹痛等病史。全身性疾病如血液性疾病引起的上消化道出血可以有血常规检查的异常。另外还有皮肤粘膜牙龈等部位的出血可以进行鉴别。