囟门闭合晚要先查明原因，然后再进行治疗，要做到早诊断、早治疗，以免影响小儿生长发育。很多疾病如佝偻病、脑积水、呆小病、染色体病、维生素D和钙不足、新生儿佝偻病等都可引起小儿囟门闭合晚。
大多数小儿都是由于缺钙和维生素D引起的，小儿会出现多汗、易惊、夜里会明显哭闹等症状。有的还会导致枕部脱发而出现枕秃，颅骨软化，用手压枕部或顶骨后方有乒乓球的感觉。小儿囟门较大而且关闭晚，需要带小儿去医院化验血液，明确之后给予补钙和补D治疗。