小儿脑肿瘤的治疗，最主要的还是要通过外科手术的方式进行治疗。因为绝大多数小儿的脑肿瘤，他是属于这种胚胎发育异常从而造成的。俗话说一点就是从娘胎里带出来的。比如说我们经常见到的胆脂瘤，畸胎瘤，颅咽管瘤等等，像这些肿瘤都是因为胚胎在发育的过程当中异位从而造成。因此通过外科手术，将这些异位的组织切除是一个非常有效的治疗方法。而且尽早是在发现之后。尽早的安排手术治疗。因为有部分的肿瘤，他有可能会侵蚀周围的颅骨，造成非常难以切除，以及术后复发的情况，比如说脊索瘤。所以及早的发现，及早拆除是非常有利于小儿脑肿瘤在后期的保护。
但还有的时候是一些先天性恶性肿瘤，比如说髓母细胞瘤以及胶质细胞瘤，那像这样的肿瘤往往不仅仅是需要手术切除，更需要后期结合放疗和化疗的方式，共同进行。尤其是像髓母细胞瘤，有的时候是要在手术之前就要进行相应的化疗。也就是通过打药的方式进一步的缩小肿瘤体积，减少肿瘤血供，那么通过外科手术进行切除，以后再进行化疗，这样共同的处理，才能够得到一个有效的预防和治疗。
但是在某些特殊情况下，小儿的脑肿瘤尤其是恶性的也是没有办法做到根治的，只能说是延长患者的生存时间。