磁共振与CT都是影像学的检查方法。在某些医院，磁共振与CT都属于放射科，但二者不是一回事，无论是在工作原理还是在检查范围，它们之间存在着很大的差异。
磁共振是利用强大的磁场作用于人体的氢原子核，使之发生共振，再经过高能电子计算机一系列后处理技术和数字重建技术，将电磁波转换成磁共振图像，用于临床诊断；而CT的工作原理是利用X射线成像技术，通过转换图像提供给临床诊断。另外，二者在疾病主要检查方面各有千秋，但是磁共振的应用范围较CT更广泛一些，在临床诊断中，二者之间有着很好的互补作用。