眼眶囊肿疾病本身一般不会引起头疼的症状出现，但是少部分并发症可能会导致头疼。
大部分眼眶囊肿都是良性的占位性病变，当眼眶囊肿体积较小时，对周边组织和头部不造成很大影响。当囊肿逐渐增大，从空间上侵占和挤压到周边结构，可导致眼球的变形，患者出现散光、斜视、眼球运动受限等症状。可能会有头晕眼花的表现，但不以头痛为主。
部分眼眶浆液性皮样囊肿，如果未及时切除，有可能会引起眶内蜂窝织炎、眶内脓肿的发生，患者会有头疼的表现。