黄连羊肝丸是一个中成药，这个药物的副作用，主要表现在胃肠道方面。因为药性苦寒，有个别患者服用后，有可能会出现上腹部不适、胃凉、胃胀，也有可能引起腹胀、腹痛或腹泻。
本药物的组方成分较多，如黄连、黄柏、黄芩、醋青皮、龙胆、柴胡等。因此，有的患者服用后，可能对其中某个中药成分不耐受，或过于敏感，也可出现过敏反应。所以，用药期间，还要多留意是否有皮肤瘙痒、起皮疹等不良反应。
黄连羊肝丸可清肝、泻火、明目，建议应在中医师辨证后正确使用。