输尿管囊肿的发病原因，主要是先天遗传因素导致的输尿管黏膜及输尿管肌层发育不全。
该病的病理改变为输尿管在膀胱壁开口处出现囊性扩张，可导致输尿管开口处严重狭窄，所以常表现为输尿管远端梗阻，这样患侧肾脏产生的尿液不能排入膀胱，继而排出体外。
随着病情进展，可引起患侧输尿管扩张、肾脏积水，则会引起患侧肾功能损害。由于尿液长时间积聚在输尿管和肾脏，很容易引起患侧输尿管、肾脏炎症及结石的发生。
所以，当发现输尿管囊肿时，需要及时到泌尿外科就诊，完善泌尿系彩超、CT等相关检查，评估病情，排除手术禁忌，尽早行手术治疗，避免引起严重的并发症。