男性尿尿的时候疼吃什么药，应根据具体的诱发原因对症合理应用药物。
如果为尿道炎引起的排尿疼痛，而且是受到淋球菌感染所致，可服用头孢克肟胶囊予以治疗。如果病情严重，可静脉滴注头孢曲松钠予以治疗。如果是受到衣原体或支原体感染而引起的尿道炎所致，则需要应用红霉素胶囊、罗红霉素胶囊等药物予以治疗。
如果为泌尿系统结石引起的排尿疼痛，在疼痛比较严重时，可服用塞来昔布、双氯芬酸钠等止痛药物。如果结石较小，可服用排石颗粒促进结石排出。如果结石较大，则需要采用体外冲击波碎石或手术取石的方式进行治疗。