导致女性月经不调的根本原因是体内的内分泌紊乱了，但是可以导致内分泌紊乱的疾病是很多的。
正常时，女性的下丘脑-垂体-卵巢轴，会有规律的分泌性激素，作用于身体的不同部位，从而形成月经。
对于部分青春期的女性，当身体发育还不是很成熟的时候，性激素的分泌不规律会引起月经不调。对于育龄期的女性，如果黄体分泌不足或者是黄体萎缩不全，也有可能导致月经不调。对于围绝经期的女性，整个身体逐渐老龄化，各个器官逐渐萎缩，导致体内内分泌紊乱，也可以出现月经不调。