感染尼帕病毒之后，部分患者可能会出现扁桃体肿大的现象，主要与个人免疫力有关。一些免疫力差，很有可能会继发细菌感染，这时可引起扁桃体炎，扁桃体在炎症的不断刺激下，会导致扁桃体组织的渗出物增多。
扁桃体血管也会有扩张充血的现象，所以会形成扁桃体肿大。除了扁桃体肿大以外，还有可能会伴随咽痛、咳嗽、咳痰、身体乏力、恶心等症状。
针对扁桃体肿大，主要以抗感染治疗为主，比如给予青霉素进行治疗，同时也要密切观测患者的各项生命体征。