鼻咽癌在晚期时会有明显的症状表现，例如头痛，有时为双侧头痛，有时则是单侧头痛，很多患者需要经过治疗才能缓解疼痛。
鼻咽癌晚期的患者还可能会有面部麻木等颅神经方面的症状，而最严重和常见的症状为远处转移，如向骨部转移，这样会导致患者出现全身疼痛。还有部分患者当肿瘤侵犯病灶周围的部位后，也会导致该部位出现相应的症状。
由于肿瘤所侵犯的部位不同、转移的部位不同，患者所产生的症状表现也会有所区别，所以是因人而异的。