大部分的肺栓塞在心脏彩超检查时都能够发现异常。
所以超声是诊断肺栓塞常用的一种影像学检查方法，而且特别适合于一些重症的患者。如果心脏彩超下能够直接发现主肺动脉内的栓子，就可以证明肺栓塞。但是也有很大一部分患者只能通过间接的征象来判断患者是否有肺栓塞，比如心脏超声表现为右心室扩张、室壁运动减弱、肺动脉扩张等。
还可以通过测量三尖瓣反流的程度来估测肺动脉压，也能够间接地判断肺栓塞。经食管的超声心动图比经胸的超声心动图阳性率会更高一些。