扁桃体化脓，通常是出现了化脓性扁桃体炎。一般是由于细菌感染引起的，最常见的致病菌是溶血性链球菌感染。
化脓性扁桃体炎首先要应用抗菌素控制感染，首选的抗菌素为青霉素，用药三天症状没有缓解的，需要更换为头孢类抗菌素或是取脓液做细菌培养，找到致病菌，选取敏感的抗菌素。
如果患者对青霉素过敏，可以服用红霉素、罗红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等药物治疗。如果口服用药效果不佳，就需要通过静脉注射用药，一般需要用药一周左右才能恢复。